أمر كل من صادق لاريجاني والرئيس الشيخ حسن روحاني بإلقاء القبض على حامد باغائي. وبعد محاكمة سرية، حٌكمَ على نائب الرئيس السابق بالسجن لمدة 15 سنة.
وتفيد التقارير الصحفية بمحاكمة تتعلق ب"الفساد"، لكن من غير المعلوم أية اتهامات ضد هذا الرجل المعروف بنزاهته.
تم تقديم حامد باغائي في الانتخابات الرئاسية لعام 2017 من قبل الرئيس السابق أحمدي نجاد. ولتسهيل إعادة انتخاب الشيخ حسن روحاني، رفض مجلس الحرس الدستوري طلب ترشحه كما رفض طلب ترشح الرئيس محمود أحمدي نجاد بذريعة أن الرجلين "ليسا مسلمين صالحين".
الجدير بالذكر أن الرئيس السابق أحمدي نجاد وأصدقاءه يطالبون، كمؤمنين، بعلمنة المؤسسات.